台灣的 14 種老鼠中,「天鵝絨鼠、台灣高山田鼠、高山白腹鼠、台灣森鼠、巢鼠、刺鼠」等 6 種為高山常見的鼠種;「屋頂鼠、家鼷鼠、溝鼠」等 3 種為一般室內常見的鼠種;「田鼷鼠、鬼鼠、小黃腹鼠、赤背條鼠、溝鼠」等 5 種為經常危害農作物的鼠種。其中,「溝鼠」為家、野兩棲的人類伴生種。
通常,在一般住宅內外活動的鼠種統稱為「家鼠」;在糧倉、倉儲作怪的鼠種統稱為「糧倉鼠」;在田野間危害農作物的鼠種統稱為「田鼠」;在野外山林間活動的鼠種則統稱為「野鼠」。
台灣 12 種鼠科老鼠若以生物位階的「屬」來分類: 屋頂鼠、溝鼠、小黃腹鼠、緬甸小鼠為「家鼠屬」的物種;家鼷鼠、田鼷鼠被視為是具備小家鼠特徵的「小鼠屬」物種;赤背條鼠、台灣森鼠為外形類似小家鼠,但體型較大,較細長等特徵的「姬鼠屬」物種;高山白腹鼠、刺鼠為具備背部灰黑色,腹部為白色細短毛特徵的「白腹鼠屬」物種;巢鼠為具備會在植物桿上築巢特徵的「巢鼠屬」物種;鬼鼠為具備體形粗大、嘴短鈍,耳短、尾粗等特徵的「板齒鼠屬」物種。